由于胰高血糖素是29个氨基酸残基组成的单链肽，以 N-末端组氨酸为起点、C 末端苏氨酸为终点 ，很多氨基酸残基都暴露在外面，受体主要在肝，肾也有降解作用。

H2N-组氨酸1-丝氨酸2-谷氨酰胺3-甘氨酸4-苏氨酸5-苯丙氨酸6-苏氨酸7-丝氨酸8-天冬氨酸9-酪氨酸10-丝氨酸11-赖氨酸12-酪氨酸13-亮氨酸14-天冬氨酸15-丝氨酸16-精氨酸17-精氨酸18-丙氨酸19-谷氨酰胺20-天冬氨酸21-苯丙氨酸22-缬氨酸23-谷氨酰胺24-色氨酸25-亮氨酸26-甲硫氨酸27-天冬氨酸28-苏氨酸29-COOH

①氨基酸少，并且衍生物同源性极高【胰高血糖素（1-29）是通过用激素原转化酶2处理胰高血糖素原产生的 ,分子量为3485Da ；胰高血糖素样肽-1（GLP-1），胰高血糖素样肽-2（GLP-2），肠高血糖素和胃泌酸调节素来源于激素原转化酶1处理的胰高血糖素原】 。
②多物种间的胰高血糖素序列具有高度同源性，难以找到高特异性的抗体。
③多肽不稳定，容易被氧化还原、容易聚集纤维化 、容易被某些蛋白酶水解使其失活 。
④需要的样本量大，样本通常需要经过纯化处理。基于胰高血糖素极度的不稳定，对其进行体外研究实验前必须要有保护其稳定的方案。目前广州市进德生物科技有限公司研发出胰高血糖素的保护剂并为其申请专利。该保护剂主要用于血液样本中胰高血糖素的保护，自身性能稳定，同时对提高胰高血糖素的稳定性有明显作用。

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